Мы живём в мире, где преподаватель ВУЗа не будет страдать такой хернёй (подменивать вирусы), т.к. это не имеет смысла.

За какие, кстати?

Интересно как. Спасибо!

А нуклеотидилтрансфераза и обратная транскриптаза это одно и то же?

To go from cell to cell, HIV is packaged in an "envelope" made from viral proteins and proteins from human cell membranes.

Чтобы переходить из клетки в клетку ВИЧ упакован в "конверт"-оболочку сделанную из вирусных протеинов и протеинов из мембраны человеческой клетки.

Прикольно написали! нет бы сразу
написали что ВИЧ это HERV эндогенный

Добавлено (24.12.10, 17:03)
---------------------------------------------

Интересно!

а чем вич отличается от других ретровирусов?

Добавлено (24.12.10, 17:12)
---------------------------------------------

Ион магния это составная молекула вича или он ее берет извне?
Получается, вич без магния не работает?

Добавлено (24.12.10, 17:13)
---------------------------------------------
Чем отличается ВИЧ от HERV?

1) Ганс, Вы признаете гипотезу о "троянском коне" (где утверждается, что вич одевается в белки клетки-хозяина), но при этом настаивете, что те же самые белки принадлежат вирусу. При этом вы загадочно упоминает, что, мол, "когда вирус путешествует от клетки к клетк"е. А где еще он может путешествовать? Как известно из самой спидологии, например, в моче или сперме вирус ни во что не одевается. А заодно как могут «отлично изученные» гены вируса кодировать хозяйские белки? Надо выбирать – либо "троянская гипотеза" чушь, и в институте Джона Хопкинса и других спидологических заповедниках маются дурью, либо отказываться об утверждении об «отлично изученных» вирусных белках. Эти две вещи взаимоисключающи.

2) Далее, Ганс, вы настаивали, что сверху конус выглядит как сфера (кстати, сфера=шар), но за ВИЧ вы признаете только частицы с коническим ядром.

3) Вы полностью проигнорировали сообщение о том, что в эфавиренце содержатся бензодиазепины.

4) Ганс, Вы не показали публике, как центрифугирование позволяет отделить клеточные макромолекулы от экзогенных, когда структура экзогенных неизвестна. Ведь именно так и случилось при «открытии» вируса! Видимо, открыватели не знакомы с физическими принципами центрифугирования и методами идентификации химических соединений.

5) Енот проигнорировал мою просьбу и не представил статистику о смертности вич+-детей, рожденных не от алкоголиков, наркоманов и гемофиликов.

TaDim, а почему Вы мне втихаря минусы ставите? Выходите и общайтесь публично или слабо?

Ну так наставьте в отместку мне - и вам сразу полегчает :))

Возможности этого форума позволяют давать оценку постам, тому, как ведет себя в дискуссии человек - и для этого не нужно общаться в открытом форуме.
Тем более, что с вами лично мне все понятно - мы общались с вами давеча - забыли разве?

Я читаю Ваши замечательные,четкие, структурированные, логически выдержанные сообщения, но почему-то у меня не возникает иных мыслей и ощущений по поводу написанного, чем я написала вам в комплиментах.

Наверное, со мной что-то не так - завидую вашему умению умно говорить или просто далеко мне до понимания написанного вами.
Пойду посыпать голову пеплом :))

Вы завидуете диссидентам, Ганс, определенно завидуете :)))

Спасибо, очень интересно!

А насчет инактивации - я имела в виду, как ВИЧ используют в "мирных" так сказать целях? я читала - что его используют для доставки генетического материала в клетки, его при этом инактивируют. Можете дать ссылочку где об этом можно почитать?

Добавлено (25.12.10, 00:49)
---------------------------------------------

Мне приходит в голову, что так называемое "выделение вич" - полностью искуственный процесс, продукт генной инженерии и клонирования. И не только мне.
Про магний и марганец надо поразмышлять...По ссылке, которую Вы дали:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16394022
Написано что активность обратной транскриптазы "вич" происходит при 6-8 мМ, тогда как in vivo концентрация магния едва ли достигает 0.2 мМ.
Значит доблестные ученые "подсыпав" магния "вич" производят

Вот еще интересная инфа к размышлению:

http://ru-patent.info/21/95-99/2198222.html

Описан процесс генетического синтеза обратной транскриптазы на основе ДНК полимеразы бактерии термофилы - та же бактерия используется в столь любимых спидологами тестах ПЦР "вирусная нагрузка" при "клонировании" обратной транскриптазы "вич". Там же и про магний с марганцем - очень интересно!

Ох я не удивлюсь если "вич" можно создать даже и без всякой человеческой крови, просто из этой самой бактерии термофилы

Вообщем еще копать и копать, вопросов море, но и они могут подождать, а пока всех с наступающим Новым Годом и Рождеством!

Добавлено (25.12.10, 00:57)
---------------------------------------------
Не ответили по поводу, почему у вич-отрицательного ребенка, ПЦР показал +. Вот они, ваши хваленые праймеры ПЦР.

Ханс, Вы не читали форум первого канала? Там уже подробно разобрали эти праймеры благодаря tgg и программе проверки геномных последовательностей Blast - и уже выяснили что эти праймеры показывают генетические последовательности соответствующие нормальному человеческому геному! Почитайте тот форум!

Я говорю про выделение "вирусной нагрузки" при ПЦР. Там написано, что ПЦР РНК ВИЧ выявлеяет обратную транскриптазу ВИЧ р24. В этом ПЦР присутствует бактерия Термофила.

А вот тут наглядно по-русски объясняется, что при выделении генных последовательностей методом ПЦР при использовании бактерии Термофилы,

1) сначала создают обратную транскриптазу из ДНК-полимеразы этой самой бактерии Термофилы (которую добывают из горячих гейзеров на Камчатке) - и ее клонируют!

2) и уже потом делают выявление генных последовательностей на основе праймера чего угодно.

http://ru-patent.info/21/95-99/2198222.html

Вот Вам и весь "вич"

Мы для вас все невеженственные а я мнению tgg доверяю, и у меня есть для этого основания. За ссылку спасибо конечно, но мне щас неохота с этими праймерами разбираться, у меня к ним вообще интерес пропал, когда я узнала что хваленый "Геном человека" не был расшифрован полностью, и в неподдающейся расшифровке части остались как раз "ретроэлементы" человеческого генома. А цитат с того форума ( и почему Вы называете его помойкой?) по этому вопросу у меня нет, зато есть цитаты по белкам, которые на иммуноблоте ищут - могу запостить (что там есть про р53!).

Там речь идет о ПЦР как методе создания обратной транскриптазы и его пошаговая инструкция.

Добавлено (25.12.10, 09:36)
---------------------------------------------

И это не на обратную транскриптазу, а на оболочку gp120.

Добавлено (25.12.10, 10:25)
---------------------------------------------
вот не поверю, что у кого либо небыло небезопасного секса (без през), вот тебе пожалуйста шифр...

Добавлено (25.12.10, 10:27)
---------------------------------------------
если человек говорит, что наркоты небыло, он монах, его спрашивают: а зубы удалял - ответ да: вот тебе и шифр...

Предвосхищая ответ диссидентов...

Рецензенты и оппоненты спят и видят как бы выдающиеся публикации с сенсационными открытиями антивичистов, проливающие свет на истинную причину СПИДа и раскрывающие заговор мировой закулисы, не пустить в печать в научных журналах.

Ибо они тоже трижды продавшиеся спидошникам.

И вообще людей, не ставящих себе первостепенной задачей уничтожение человечества с целью наживы кроме вич-диссидентов и не осталось-то в этом мире...

А... ну еще антипрививочники - куда без них...

Какие могут быть основания доверять в научных вопросах человеку, который двух белков отличить не может? Какое у этого человека вообще образование? Учитель английского языка?

Разница какая? Я привёл праймеры, которые обычно используют в ПЦР именно для тестирования на ВИЧ. Их специфичность бесспорна и очевидна.

Давайте.

Антитела новорожденным не тестируют, потому что у них еще активны материнские антитела - именно поэтому "благородная" СПИД наука тестирует новорожденных ПЦР. Вот только диагноз по ПЦР ставить нельзя, о чем и написано на вкладыще к нему от производителя.

угу а то и маникюр-педикюр виноват...

Что ж они не интересуются то ничем? Неплохо вы их зазомбировали.

У Вас все беспорно и очевидно! Может Вы и вирус своими глазами видели?

Почему у меня? У всех, кто занимается наукой, а не болтовнёй. ПЦР себя отлично зарекомендовала.

А Вы не читали что ли? Думал, знаете. Но это так, шалости, когда стажировка в Альбасете была.

Вот Вам инструкция:

http://www.fda.gov/downloads/ForConsumers/ByAudience/ForPatientAdvocates/HIVandAIDSActivities/UCM127330.pdf

Ээээ нет, в таком деле как мифический "вич" надо ориентироваться только и только на производителей
Сколько уже судебных дел был - и все против производителей (а не против СЦ где работают "эксперты"...хотя может и против СЦ уже были, я пока не встречала)! они - производители это знают, так что то что пишут они надо читать очень и очень внимательно.

Добавлено (25.12.10, 15:18)
---------------------------------------------

Я тоже не читала! Hans, а где можно почитать?

Кстати в том же вкладыше написано, что ПЦР определяет не р120 - оболочку, а р24- ядро. Про оболочку мы уже поняли все - ее вич как заправский троянский конь берет из мембраны клетки хозяина, а в таком случае о какой "вич-специфичности" белков оболочки вообще может идти речь?

Антигенные ВИЧ-белки, как думают, кодируются тремя генами, а именно: gag, pol и env. Gag-ген кодирует клетку-предшественника p53/55, которая, затем, разделёна на p24/25 и p17/18. Pol кодирует p31/32, и env ген кодирует белок клетки-предшественника p160, который разделён на p120 и p41/p45.
-------------------------
Ген pol кодирует 3 фермента: протеазу (р22), обратную транскриптазу (р64/53) и эндонуклеазу (р31).
----------------------------
Molecule: HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (SUBUNIT P66)
Polymer: 1 Type: polypeptide(L) Length: 560
Chains: A, C, E, G
EC#: 2.7.7.49
Molecule: HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (SUBUNIT P51)
Polymer: 2 Type: polypeptide(L) Length: 440
Chains: B, D, F, H
EC#: 2.7.7.49

------------------------------------

Образцы считаются отрицательными на антитела к ВИЧ, если не одна из полосок не проявляется.
Образцы считаются положительными на антитела к ВИЧ, если проявляются любые 2 полоски из трех: p24, gp41 and gp120/160.
Все другие варианты проявления полос считаются неопределенными.)
--------------------------------------------
Руководство для интерпретации результатов ВИЧ-тестирования -
h ttp://www.nrl.gov.au/hosting/serology/NRLAttach.nsf/Images/HIVInterpretation.pdf/$File/HIVInterpretation.pdf

Отрицательный результат - нет реакции на вирусные протеины.
Положительный - 1 ENV + 3 из GAG и POL.
Сомнительные делятся на 4 группы:
1)Любые протеины, но нет p18, p24 и нет из группы ENV;
2)Любые протеины включая p18, но нет p24 и нет из группы ENV;
3)Любые протеины включая p24, но нет из группы ENV;
4)ENV, но меньше чем 3 из GAG и POL;

Далее 1/2 и 3/4 обрабатываются по разным алгоритмам

сценарии 3/4:
1)Если белок p24 отсутствует, то это может говорить об индивидуальной реакции не связанной с вирусом, либо о том, что заражение произошло недавно
В этом случае тест сдается каждые 6 недель.
Если в течении 12 недель белок p24 по прежнему отсутствует и нет показаний о риске, либо симптомах результат признается отрицательным.
2)Если белок p24 присутствует это говорит о высокой вероятности наличия вируса ВИЧ. В этом случае необходимо пересдать тест на случай будет ли результат положительный.

Ещё одни рекомендации
h ttp://www.ashm.org.au/images/pdfs/publications/gpandhivbooklet_web.pdf
"Такие факторы, как беременность, переливание крови прошлого, сопутствующих вирусных инфекций, аутоиммунные заболевания и злокачественные опухоли могут играть определенную роль при получении неопределенных результатов. После повторного тестирования приблизительно через 2 недели, второй неопределенный результат, если не было замечено прогресса при WB-тестировании ВИЧ, рассматривается как подтверждение отрицательного статуса."

В связи с этим интересует - насколько различалось бы количество положительных результатов у нас в России, если бы у нас использовалась Австралийская система. Не может ли кто-нибудь из имеющих доступ к результатам тестирования провести подобный анализ, либо предоставить доступ к этим данным?

-----------------------------------------------------------------------------

Там нанесены белки:
gag p17, p24, p55 (оболочка)
pol p31 (эндонуклеаза), p51, p65 (обратная транскриптаза)
env gp 41 (трансмембранный белок)
gp120, gp 160 (поверхностные структуры)
или есть еще какие-то? на полоске Д отчетливо видны 8 полос. Это реакция на какие белки?

-------------------------------------------------------------------------

Принцип метода заключается в выявлении антител к определенным белкам вируса, иммобилизованным на нитроцеллюлозную мембрану. Белки оболочки вируса (env) ВИЧ-1, обычно обозначаемые как гликопротеины, (гп) с молекулярным весом, обозначаемым в килодальтонах (кд): 160кд, 120кд, 41кд. У ВИЧ-2 гликопротеины имеют вес 140кд, 105кд, 36кд. Белки сердцевины (gag) (обычно обозначаемые как протеины) у ВИЧ-1 имеют молекулярный вес соответственно 55кд, 24кд, 17кд, а ВИЧ-2 - 56кд, 26кд. 18кд. Ферменты ВИЧ-1 (pol) имеют молекулярный вес 66 кд, 51 кд, 31кд, ВИЧ-2 - 68кд.

Результаты, полученные в иммунном блотинге, интерпретируются, как положительные, сомнительные и отрицательные.

Положительными (позитивными) считаются пробы, в которых обнаруживаются антитела к 2 или 3 гликопротеинам ВИЧ.

Отрицательными (негативными) считаются сыворотки, в которых не обнаруживается антител ни к одному из антигенов (белков) ВИЧ.

Пробы, в которых обнаруживаются антитела к одному гликопротеину ВИЧ и/или каким-либо протеинам ВИЧ, считаются сомнительными (неопределенными или не интерпретируемыми).

----------------------------------------------------------------------

Сыворотки лиц, инфицированных ВИЧ-1, обнаруживают антитела к следующим основным белкам и гликопротеидам - структурным белкам оболочки (env) - gp160, gp120, gp41; ядра (gag) - p17, p24, p55, а также ферментов вируса (pol) - p31, p51, p66. Для ВИЧ-2 типичны антитела к env - gp140, gp105, gp36; gag - p16, p25, p56; pol - p68.

Среди лабораторных методов, необходимых для установления специфичности реакции, наибольшее признание имеет обнаружение антител к белкам оболочки ВИЧ-1- gp41, gp120, gp160, и ВИЧ-2 - gp36, gp105, gp140. Однако и здесь имеются некоторые расхождения между мнениями отдельных исследовательских групп.

Так, ВОЗ считает положительными сыворотки, в которых методом иммунного блотинга обнаруживаются антитела к каким-либо двум гликопротеидам ВИЧ (7). Согласно этим рекомендациям, при наличии реакции только с одним из белков оболочки (гп 160, гп 120, гп 41) в сочетании или без реакции с другими белками, результат считается сомнительным и рекомендуется повторное исследование, используя набор другой серии или другой фирмы. Если и после этого результат остается сомнительным, рекомендуется наблюдение в течение 6 месяцев (исследования через 3 месяца).

----------------------------------------------
Варлок, может вы тогда для меня ответите конкретно по картинке. На варианте Д видны 8 полос, это значит реакция с 8-ю конкретными белками из набора: gag p17, p24, p55 (оболочка) pol p31 (эндонуклеаза), p51, p65 (обратная транскриптаза) env gp 41 (трансмембранный белок) gp120, gp 160 (поверхностные структуры) и + из вашей цитаты: gp140, gp105, gp36; gag - p16, p25, p56; pol - p68?
То есть максимальное количество полос в тесте 16?
--------------------------------------------

В данном случае белки ВИЧ-2 тест не определяет. 2 из белков скорее всего совмещены. Существуют ли тест на ВИЧ1 и ВИЧ2 одновременно не знаю.

Тут расписаны белки для положительного результата по разным регионам.

h ttp://www.theperthgroup.com/OTHER/Genelabswb.pdf
h ttp://www.theperthgroup.com/OTHER/wbchart.doc

группы белков(номера из этих источников)
ENV - p41, p120, p160
POL - p32, p53, p68
GAG - p18, p24, p39, p55

Африка - 2 ENV(как у нас)
Австралия - 1 ENV + 3 GAG или POL
FDA(США) - 1 ENV + p24 +p32
RCX(США) - 1 ENV + 1 GAG + 1 POL
CDC1(США) - p120/p160 + p41
CDC2(США) - (p120/p160 или p41) + p24
CON(США) - (p120/p160 или p41) + (p24 или p32)
Германия - 1 ENV + 1 GAG или POL
Великобритания - 1 ENV + p24 +p32
Франция - 3 ENV + 1 GAG или POL
MAC(США?1983-1992) - 3 слабых полосы или 1 сильная

CDC/ASTPHLD - 2 из (p41 или p120/p160 или p24)
SFTS France (положительный) - 2 ENV (gp160 и gp120) + 1 GAG или POL
(сомнительный) - Env (gp160) и GAG(p24)
(сомнительный) - 2 ENV (gp160 и gp120)
ВОЗ(применяется в Африке) - 2 ENV с другими белками или без
Paul Ehrlich Institut (Германия) из двух полос 1 должен быть ENV
Китай - 2 ENV (gp160/gp41 и gp120) + GAG или POL
Сингапур - 2 ENV (gp160/gp41 и gp120) + GAG или POL

То есть в Австралии действительно нужно 4 полосы.

------------------------------------------------------------
gag p17, p24, p55 (оболочка)
pol p31 (эндонуклеаза), p51, p65 (обратная транскриптаза)
env gp 41 (трансмембранный белок)
gp120, gp 160 (поверхностные структуры)

Итого - 12 антигенов. Эти антигены и имеют вид поперечных полосочек в трактуемом результате.

-------------------------------------------------------------

Вестерн блот позволяет обнаружить антитела к белкам ВИЧ-1, в том числе белкам сердцевины вируса (p17, p24, p55), гликопротеинам оболочки (gp41, gp120, gp160) и ферментам (p31, p51, p66). Положительный результат ИФА всегда следует подтверждать при помощи вестерн блота, поскольку у ИФА 2% ложноположительных результатов. Результаты вестерн блота интерпретируются следующим образом (Am J Med 2000; 109:568):

отрицательный: отсутствие полос;
положительный: полосы, указывающие на наличие антител к gp120/160 + либо к gp41, либо к p24;
неопределенный: наличие любых полос, сочетание которых не удовлетворяет критериям положительного результата

------------------------------------------------------
Это цитаты с 1тв форума. Вы видите что в этих белках нет никакой определенности? И даже их массы пишутся по разному в разных тестах.
Каким образом эти белки определяются по их молекулярной массе, что это "вич" белки?
Обратите внимание на выделенный жирным р53

Все еще меня не оставляет сомнение что это может быть кому то действительно интересно - еще раз ссылка на что такое :

http://en.wikipedia.org/wiki/P53

Добавлено (25.12.10, 15:52)
---------------------------------------------

Неужели? Дайте ссылочку на ОТ-ПЦР...ни разу не видела, давно ищу.

Добавлено (25.12.10, 15:56)
---------------------------------------------

О да, все эти сотни и тысячи специалистов конечно видели "вич" воочию

Добавлено (25.12.10, 16:00)
---------------------------------------------
к р53 есть свои антитела кстати:

http://p53.bii.a-star.edu.sg/aboutp53/antibody/antibodyresult.php

Там и 24 и 19 по массе есть.

Это вы интуитивно определили, не читамши?
Из той самой инструкции:
The AMPLICOR HIV-1 MONITOR Test is based on five major processes: specimen preparation:
reverse transcription (RT) of target RNA to generate complementary DNA (cDNA); PCR
amplification of target cDNA using HIV-1 specific complimentary primers; hybridization of the
amplified products to oligonucleotide probes specific to the target(s); and detection of the probebound
amplified products by calorimetric determination.

ТщательнЕе надо, тщательнЕе...(с)

Еще как может:
In the U.S., the HIV DNA polymerase chain reaction (PCR) assay is used most widely for diagnosis of HIV infection during infancy. Testing generally should be performed in the immediate newborn period, at one to two months of age, and at age three to six months.
Это в США, если кто-то не понял.
А вот что творится в России:
Достоверную информацию о том, передался или нет ребенку ВИЧ, можно будет получить только к 1,5 годам, когда антитела матери заменяются собственными антителами ребенка. Для того, чтобы судить о ВИЧ-статусе детей до этого срока, обычно используется количественный или качественный тест ПЦР на выявление ВИЧ в крови младенца. Через 4 недели после родов ПЦР достоверен на 90%, а в возрасте 6 месяцев его достоверность - около 99%.

Плюс описаны любопытнейшие случаи высокой ВН у многократно ВИЧ-отрицательных:

http://www.aidsmap.com/page/1429804/

Мало того, предлагается исключить вич у вич-отрицательных с помощью ПЦР:
“our case, albeit rare, further supports the use of HIV RNA testing to exclude HIV infection in HIV-seronegative individuals.”

Даже среди самих спидологов очевидны разброд и шатания

В смысле? Ну вот пошаговый протокол.

А что, нет что ли?

Это просто песня какая-то. Согласно автору, ген gag кодирует стволовую клетку (клетка-предшественник — стволовая клетка) под название p53/55. Это даже не смешно, это... слов нет. По факту: gag кодирует полипротеин p55, который протеаза расщепляет на p6, p7, p17, p24 [1].

1. Levy J.A. HIV and the pathogenesis of AIDS. — USA: American Society for Microbiology, 2007, p. 8

Вся остальная путаница с названиями белков связана, скорее всего, с тем, что автор использует материалы разного времени, а названием белков меняются. У одного белка есть несколько названий. Нас интересует полипетид p53. Это обратная транскриптаза ВИЧ-1.

Обратная транскриптаза имеет ещё несколько значений: p64 в процитированном тексте и p66 в современной научной литературе. Вот её последовательность:

И так, мы понимаем, что p66 RT ВИЧ-1 — это ОТ, в то время как по ссылке на wikipedia — совсем другой белок, опухолевый супрессор p53. Вот его последовательность:

Совершенно очевидно, что это разные белки.

Не вижу. С самими белками всё нормально, неопределённость в головах людей. Кто-то может разобраться о чём речь, а кто-то нет.

Указывается приблизительная молекулярная масса.

Никаким. По молекулярной массе никто белки не определяет, определяют по их аминокислотной последовательности. По молекулярной массе даётся лишь кроткое название.